Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4dQ8BGV9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg4dQ8BGV9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg4dQ8BGV9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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