Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ubp1Q811S7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubp1Q811S7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ubp1Q811S7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubp1Q811S7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubp1Q811S7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ubp1Q811S7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ubp1Q811S7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ubp1Q811S7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubp1Q811S7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubp1Q811S7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubp1Q811S7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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