Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms