Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rims3Q80U57 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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