Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

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Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Clec16aQ80U30 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec16aQ80U30 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.1 ms