Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NischQ80TM9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NischQ80TM9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms