Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf7ipQ7TT18 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms