Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms