Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms