Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snd1Q78PY7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms