Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ubfd1Q78JW9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ubfd1Q78JW9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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