Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cspg5Q71M36 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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