Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trak1Q6PD31 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms