Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp49Q6P9L4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp49Q6P9L4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp49Q6P9L4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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