Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC061212Q6P8K3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms