Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg16l2Q6KAU8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms