Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ParpbpQ6IRT3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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