Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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