Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Fbxo27Q6DIA9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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