Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgd6Q69ZL1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms