Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pkp4Q68FH0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pkp4Q68FH0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pkp4Q68FH0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pkp4Q68FH0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pkp4Q68FH0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp4Q68FH0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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