Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slain1Q68FF7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms