Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja3Q64448 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja3Q64448 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms