Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ifit1Q64282 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifit1Q64282 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms