Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms