Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ift52Q62559 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms