Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ss18Q62280 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms