Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sin3bQ62141 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sin3bQ62141 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sin3bQ62141 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sin3bQ62141 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sin3bQ62141 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sin3bQ62141 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sin3bQ62141 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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