Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcd1Q61466 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd1Q61466 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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