Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd53Q61451 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd53Q61451 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd53Q61451 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cd53Q61451 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd53Q61451 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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