Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cln3Q61124 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms