Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usf1Q61069 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usf1Q61069 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usf1Q61069 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usf1Q61069 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usf1Q61069 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usf1Q61069 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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