Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Epha1Q60750 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Epha1Q60750 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms