Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samhd1Q60710 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms