Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SkiQ60698 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms