Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms