Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CttnQ60598 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms