Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3aQ60520 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3aQ60520 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms