Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim38Q5SZ99 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim38Q5SZ99 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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