Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms