Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Zzef1Q5SSH7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms