Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trappc1Q5NCF2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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