Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam208bQ5DTT3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms