Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syne3Q4FZC9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syne3Q4FZC9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms