Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx25Q3ZT31 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms