Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ulk4Q3V129 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms