Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lrrc43Q3V0L5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lrrc43Q3V0L5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lrrc43Q3V0L5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lrrc43Q3V0L5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Lrrc43Q3V0L5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms