Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prdm6Q3UZD5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Prdm6Q3UZD5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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