Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms