Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Usp19Q3UJD6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp19Q3UJD6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms